谢谢..那么MEGA或者clustalx可否对不同序列长度的序列做比对?我找出的同一种酶在不同物种中的序列,可长度不等..这样是否也能比较同源性?做进化树就可以吗?

来源：学生作业帮助网 编辑：作业帮 时间：2024/05/04 20:46:31
谢谢..那么MEGA或者clustalx可否对不同序列长度的序列做比对?我找出的同一种酶在不同物种中的序列,可长度不等..这样是否也能比较同源性?做进化树就可以吗?

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谢谢..那么MEGA或者clustalx可否对不同序列长度的序列做比对?
我找出的同一种酶在不同物种中的序列,可长度不等..这样是否也能比较同源性?做进化树就可以吗?

谢谢..那么MEGA或者clustalx可否对不同序列长度的序列做比对?我找出的同一种酶在不同物种中的序列,可长度不等..这样是否也能比较同源性?做进化树就可以吗?
长度不等是正常的,不可能每个物种的同源基因连长度都相等,这个可能性几乎为零,软件进行同源比对就是从差异中找相同,当然找同源基因的话除了对序列进行同源比对外最好再对该基因家族的保守序列进行一下分析,确定你找到的这些序列确实为同一家族基因.
还有我不知道你是否懂多序列比对的含义,它与NCBI上的alignment个人感觉是不同的,多序列比对不同于简单的alignment,如果你知道的话就当我没说：）,当然这都是个人感觉,没有细研究过.有问题或者有不同看法再给我发信息吧,这两天做实验比较忙,看到你的消息我会尽快回的

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